Gestion et analyse de la variabilité génétique d’une lignée de porcs développant spontanément des mélanomes
mardi 3 octobre 2006.
Responsable(s) Scientifique(s) :
Claudine GEFFROTTIN (INRA/CEA- LREG)
Pascale Le ROY - Hélène GILBERT (INRA-SGQA)
Objectifs :
Le mélanome porcin constitue un modèle pour certaines formes de mélanome humain. La gestion de la population porcine à la SGQA a eu pour but :
Etude de l’évolution et des traitements du mélanome porcin (dévitalisation des tumeurs, effet des radiations,...).
Etude du déterminisme génétique de la maladie (implication de la région SLA sur le chromosome 7).
Moyens mis en œuvre :
La base de l’expérimentation est la constitution à l’INRA d’un troupeau croisé entre une lignée mélanique appelée MeLiM importée de Libéchov (République Tchèque) et la race Duroc. Une population de type back-cross a été constituée : 4 MeLiM affectés croisés avec 5 Duroc sains, permettant d’obtenir 9 F1 malades qui ont été croisés avec 26 Duroc sain pour produire 331 backcross. Ces animaux ont été produits et élevés sur l’élevage INRA de Rouillé (unité expérimentale GEPA, Poitou-Charentes). 153 marqueurs microsatellites ont été génotypés, et le nombre et degré de développement de lésions mélaniques a été enregistré pour tous les animaux selon un protocole développé au Laboratoire de Radiobiologie et Etude du Génome. Le logiciel QTLMAP a été utilisé pour la cartographie des locus impliqués dans le développement spontané du Mélanome.
Principaux résultats à la date de mise à jour :
De nombreux QTL significatifs entre 5% à l’échelle du chromosome et 1%o à l’échelle du génome ont été mis en évidence grâce à ce protocole pour l’ensemble des caractères étudiés (Du et al 2006). Certaines régions présentent des homologies avec les régions de susceptibilité décrites dans l’espèce humaine, d’autres sont des nouvelles localisations.
Date de mise en œuvre et durée prévue :
Les premiers croisements ont été effectués en 1997. Ils se poursuivent maintenant pour la cartographie fine des QTL (cf cartographie fine des locus de susceptibilité au Mélanome chez le porc)
Unité(s) de Recherche partenaire(s) :
Station de Génétique Quantitative et Appliquée (Jouy-en-Josas).
Laboratoire de Radiobiologie et d’étude du génome (INRA/CEA, Jouy-en-Josas).
Elevage expérimental porcin de Rouillé (GEPA, Poitou-Charentes)
Partenaire(s) extérieur(s) :
Institute of Animal Physiology and Genetics, 27721 Libechov, Czech Republic
Financement :
Dotation de l’Association de Recherche contre le Cancer (7,6 KEuros) en 1999
Publications :
Geffrotin, C., C. Le Chalony, P. Le Roy, F. Crechet, J. J. Leplat, V. Horak, J. Gruand, S. Vincent-Naulleau. 2001. A new model of porcine cutaneous melanoma : Investigation of p16/cdkn2a, cdk4 and chromosome 13q3.1 involvment. In : Abstract book : eight World Congress on Cancer of the Skin, Zürich, Switzerland, July 18-21, 2001. p 45.
LE CHALONY C., RENARD C., VINCENT-NAULLEAU S., CRECHET F., LEPLAT J.J., TRICAUD Y., HORAK V., GRUAND J., LE ROY P., FRELAT G., GEFFROTIN C. 2002. CDKN2A region polymorphismand genetic susceptibility to melanoma in the MeLiM swine model of familial melanoma. Int. J. Cancer, 103, 631.
GEFFROTIN C., CRECHET F., LE CHALONY C., LE ROY P., LEPLAT J.J., RENARD C., GRUAND J., MILAN D., IANNUCCELLI N., HORAK V., TRICAUD Y., FRELAT G., VINCENT-NAULLEAU S. A genome-wide scan for familial melanoma in the MeLiM Swine model. XVIIIth International Pigment Cell Conference, Egmond aan Zee, The Netherlands, September 9-13, 2002, Pigment Cell Res., 2002, 15 (supl. 9), p.64.
GEFFROTIN C., CRECHET F., LE ROY P., LE CHALONY C., LEPLAT J.J., BARBOSA A., RENARD C., GRUAND J., MILAN D., IANNUCCELLI N., HORAK V., TRICAUD Y., BOUET S., FRANCK M., FRELAT G., VINCENT-NAULLEAU S. Identification of five chromosomal regions involved in predisposition to melanoma by genome-wide scan in the MeLiM swine model. Int. J. Cancer, 2004, 110, 39-50.
VINCENT-NAULLEAU S., LE CHALONY C., LEPLAT J.J., BOUET S., BAILLY C., SPATZ A., VIELH P., AVRIL M.F.,TRICAUD Y., GRUAND J., HORAK V., FRELAT G., GEFFROTIN C. Clinical and histopathological characterization of cutaneous melanomas in the Melanoblastoma-bearing Libechov Minipigs Model. Pigment Cell Res., 2004, 17, 24-35.
LE CHALONY C., RENARD C., VINCENT-NAULLEAU S., CRECHET F., LEPLAT J.J., TRICAUD Y., HORAK V., GRUAND J., LE ROY P., FRELAT G., GEFFROTIN C. CDKN2A region polymorphism and genetic susceptibility to melanoma in the MELIM swine model of familial melanoma. Int. J. Cancer, 2003, 103, 631-635.
DU Z.-Q., VINCENT-NAULLEAU S., GILBERT H. , VIGNOLES F., CRÉCHET F., SHIMOGIRI T., YASUE H., LEPLAT J.-J., BOUET S., GRUAND J., HORAK V., MILAN D., LE ROY P., GEFFROTIN C., Detection of Novel Quantitative Trait Loci for Cutaneous Melanoma by Genome-wide Scan in the MeLiM Swine Model, Int. J. Cancer, 2006.